Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK2Q13002 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms