Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXI1Q12951 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI1Q12951 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 387.4 ms