Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAPQ12770 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPQ12770 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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