Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 NUP85YJR042W 2235 nt4.63□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 RPN3YER021W 1572 nt4.63□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 RDI1YDL135C 609 nt4.63□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 KCH1YJR054W 1494 nt4.63□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 YPK9YOR291W 4419 nt4.63□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 ESF1YDR365C 1887 nt4.63□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 NOP2YNL061W 1857 nt4.63□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 ZDS1YMR273C 2748 nt4.62□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 TAF1YGR274C 3201 nt4.62□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 YIL169CYIL169C 2988 nt4.62□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 GPI14YJR013W 1212 nt4.62□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 DIB1YPR082C 432 nt4.62□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 DAN4YJR151C 3486 nt4.61□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 YER134CYER134C 537 nt4.61□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 GUS1YGL245W 2127 nt4.61□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 NNK1YKL171W 2787 nt4.61□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 CMR1YDL156W 1569 nt4.61□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 GRE1YPL223C 507 nt4.6□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 DDC1YPL194W 1839 nt4.6□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 ARO9YHR137W 1542 nt4.6□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 HEH2YDR458C 1992 nt4.6□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 NAB6YML117W 3405 nt4.6□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 YPS6YIR039C 1614 nt4.6□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 YPL276WYPL276W 438 nt4.59□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 GAS4YOL132W 1416 nt4.59□□□□□ -1.67
TY2B-BQ12491 RPS21AYKR057W 264 nt4.58□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 CDC14YFR028C 1656 nt4.58□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 YDR396WYDR396W 501 nt4.58□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 YGR016WYGR016W 573 nt4.58□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 PEX18YHR160C 852 nt4.58□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 PAU23YLR037C 375 nt4.58□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 CBP3YPL215W 1008 nt4.58□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 YPR136CYPR136C 513 nt4.58□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 YML037CYML037C 1023 nt4.57□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 YOL107WYOL107W 1029 nt4.57□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 MSN1YOL116W 1149 nt4.57□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 SPT23YKL020C 3249 nt4.56□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 CHA4YLR098C 1947 nt4.56□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt4.56□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 STV1YMR054W 2673 nt4.56□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 MDM34YGL219C 1380 nt4.56□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 YOR022CYOR022C 2148 nt4.56□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 RPS11AYDR025W 471 nt4.55□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt4.55□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 YIL175WYIL175W 318 nt4.55□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt4.55□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 PRX1YBL064C 786 nt4.55□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 XRN1YGL173C 4587 nt4.55□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 WTM2YOR229W 1404 nt4.55□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 BLM10YFL007W 6432 nt4.55□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 ATG2YNL242W 4779 nt4.55□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 GPI18YBR004C 1302 nt4.55□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 VTC4YJL012C 2166 nt4.55□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 YLR297WYLR297W 390 nt4.55□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 TOM7YNL070W 183 nt4.55□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 SPT6YGR116W 4356 nt4.54□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 PDR3YBL005W 2931 nt4.54□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 NAM2YLR382C 2685 nt4.54□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 VAC7YNL054W 3498 nt4.54□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 SIR1YKR101W 1965 nt4.54□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 ILS1YBL076C 3219 nt4.53□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 YLR001CYLR001C 2589 nt4.53□□□□□ -1.68
TY2B-BQ12491 ERP6YGL002W 651 nt4.53□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 PEX32YBR168W 1242 nt4.53□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 SRP40YKR092C 1221 nt4.52□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 RGC1YPR115W 3252 nt4.52□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 AFT1YGL071W 2073 nt4.52□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 FKH1YIL131C 1455 nt4.51□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 YPL109CYPL109C 1974 nt4.51□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 BCP1YDR361C 852 nt4.51□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 YDR526CYDR526C 471 nt4.51□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 TUM1YOR251C 915 nt4.5□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 TRM44YPL030W 1704 nt4.5□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 YPL150WYPL150W 2706 nt4.5□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 RNR2YJL026W 1200 nt4.5□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 YKL107WYKL107W 930 nt4.5□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 PAM18YLR008C 507 nt4.5□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 IDP2YLR174W 1239 nt4.5□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 snR43snR43 209 nt4.5□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 MMR1YLR190W 1476 nt4.5□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 PRS5YOL061W 1491 nt4.5□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 TFB2YPL122C 1542 nt4.49□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 TMA108YIL137C 2841 nt4.49□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 CSM3YMR048W 954 nt4.49□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 ARP4YJL081C 1470 nt4.49□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 YDL180WYDL180W 1644 nt4.49□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 SEC9YGR009C 1956 nt4.48□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 ABD1YBR236C 1311 nt4.48□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 SMC6YLR383W 3345 nt4.48□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 FZF1YGL254W 900 nt4.48□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 CCW14YLR390W-A 717 nt4.48□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 SHH3YMR118C 591 nt4.47□□□□□ -1.69
TY2B-BQ12491 VEL1YGL258W 621 nt4.46□□□□□ -1.7
TY2B-BQ12491 CUZ1YNL155W 825 nt4.46□□□□□ -1.7
TY2B-BQ12491 KTR7YIL085C 1554 nt4.46□□□□□ -1.7
TY2B-BQ12491 RSM24YDR175C 960 nt4.45□□□□□ -1.7
TY2B-BQ12491 DCS1YLR270W 1053 nt4.45□□□□□ -1.7
TY2B-BQ12491 GUP1YGL084C 1683 nt4.45□□□□□ -1.7
TY2B-BQ12491 AYT1YLL063C 1425 nt4.45□□□□□ -1.7
TY2B-BQ12491 CWH41YGL027C 2502 nt4.45□□□□□ -1.7
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