Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY3A-G	Q12173	FAS2	YPL231W	5664 nt		4.06	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	CMK1	YFR014C	1341 nt		4.06	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	NRK1	YNL129W	723 nt		4.06	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	FDH1	YOR388C	1131 nt		4.06	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	INA17	YPL099C	549 nt		4.06	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	BSD2	YBR290W	966 nt		4.06	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	FRM2	YCL026C-A	582 nt		4.06	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	ROK1	YGL171W	1695 nt		4.06	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	RKM3	YBR030W	1659 nt		4.06	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	ALG11	YNL048W	1647 nt		4.06	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	NUG1	YER006W	1563 nt		4.06	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	RDS1	YCR106W	2499 nt		4.05	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	SIR1	YKR101W	1965 nt		4.05	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	SKP2	YNL311C	2292 nt		4.05	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	YRB30	YGL164C	1323 nt		4.05	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	VAC17	YCL063W	1272 nt		4.05	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	RPS11A	YDR025W	471 nt		4.05	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	ATP5	YDR298C	639 nt		4.05	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	YGR161W-C	YGR161W-C	279 nt		4.05	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	YLR374C	YLR374C	390 nt		4.05	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	RNA1	YMR235C	1224 nt		4.05	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	YSF3	YNL138W-A	258 nt		4.05	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	YAR1	YPL239W	603 nt		4.05	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	PUF2	YPR042C	3228 nt		4.05	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	VMA1	YDL185W	3216 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	GAL11	YOL051W	3246 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	SRO7	YPR032W	3102 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	SLA1	YBL007C	3735 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	PCL10	YGL134W	1302 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	YGL262W	YGL262W	528 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	ASC1	YMR116C	960 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	PWR1	PWR1	941 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	BMT2	YBR141C	1014 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	POF1	YCL047C	777 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	YRM1	YOR172W	2361 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	PMT6	YGR199W	2280 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	TPA1	YER049W	1935 nt		4.03	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	ALO1	YML086C	1581 nt		4.03	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	HSP42	YDR171W	1128 nt		4.03	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	RRP17	YDR412W	708 nt		4.03	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	SPO73	YER046W	432 nt		4.03	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	YGR017W	YGR017W	894 nt		4.03	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	TMA19	YKL056C	504 nt		4.03	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	IRC25	YLR021W	540 nt		4.03	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	FKH1	YIL131C	1455 nt		4.03	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	KIP3	YGL216W	2418 nt		4.02	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	WHI4	YDL224C	1950 nt		4.02	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	VPS45	YGL095C	1734 nt		4.02	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	YEL028W	YEL028W	462 nt		4.02	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	YGR139W	YGR139W	339 nt		4.02	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	POC4	YPL144W	447 nt		4.02	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	YBR103C-A	YBR103C-A	144 nt		4.02	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	CDC14	YFR028C	1656 nt		4.02	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	KRE5	YOR336W	4098 nt		4.02	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	ECM22	YLR228C	2445 nt		4.02	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	GEM1	YAL048C	1989 nt		4.02	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	URC2	YDR520C	2319 nt		4.01	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	SPT10	YJL127C	1923 nt		4.01	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	MTC3	YGL226W	372 nt		4.01	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	YLR428C	YLR428C	345 nt		4.01	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	SNO1	YMR095C	675 nt		4.01	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	SIN3	YOL004W	4611 nt		4.01	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	GLO3	YER122C	1482 nt		4	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	HIM1	YDR317W	1245 nt		4	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	YLR345W	YLR345W	1530 nt		4	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	JIP5	YPR169W	1479 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	YMR114C	YMR114C	1107 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	CAT5	YOR125C	702 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	SPO1	YNL012W	1896 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	TCM62	YBR044C	1719 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	RAD2	YGR258C	3096 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	YGR018C	YGR018C	330 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	YBL059W	YBL059W	582 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	TAF7	YMR227C	1773 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	DBP3	YGL078C	1572 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	PEP7	YDR323C	1548 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	CDC45	YLR103C	1953 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	YDR271C	YDR271C	372 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	AIM22	YJL046W	1230 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	CMR3	YPR013C	954 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	CKS1	YBR135W	453 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	PTA1	YAL043C	2358 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	PRP9	YDL030W	1593 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	DSF2	YBR007C	2211 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	SPT23	YKL020C	3249 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY3A-G	Q12173	VPS36	YLR417W	1701 nt		3.96	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	DIN7	YDR263C	1293 nt		3.96	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	YER076C	YER076C	909 nt		3.96	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	DSD1	YGL196W	1287 nt		3.96	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	TIM21	YGR033C	720 nt		3.96	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	AHP1	YLR109W	531 nt		3.96	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	UPS2	YLR168C	693 nt		3.96	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	STP22	YCL008C	1158 nt		3.96	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	PRM2	YIL037C	1971 nt		3.95	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	APP1	YNL094W	1764 nt		3.95	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	NOP6	YDL213C	678 nt		3.95	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	PSR1	YLL010C	1284 nt		3.95	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	PRX1	YBL064C	786 nt		3.95	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	ECM8	YBR076W	1065 nt		3.95	□□□□□ -1.78
TY3A-G	Q12173	SNF2	YOR290C	5112 nt		3.95	□□□□□ -1.78

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