Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
APOBRQ0VD83 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBRQ0VD83 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms