Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C2orf54Q08AI8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms