Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SLFN5Q08AF3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms