Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CD47Q08722 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD47Q08722 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD47Q08722 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD47Q08722 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD47Q08722 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD47Q08722 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD47Q08722 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD47Q08722 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD47Q08722 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD47Q08722 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD47Q08722 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD47Q08722 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD47Q08722 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD47Q08722 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD47Q08722 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD47Q08722 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD47Q08722 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD47Q08722 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD47Q08722 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD47Q08722 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD47Q08722 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD47Q08722 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD47Q08722 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD47Q08722 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD47Q08722 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD47Q08722 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD47Q08722 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD47Q08722 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD47Q08722 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD47Q08722 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD47Q08722 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD47Q08722 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD47Q08722 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD47Q08722 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD47Q08722 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD47Q08722 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD47Q08722 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD47Q08722 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD47Q08722 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD47Q08722 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD47Q08722 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD47Q08722 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD47Q08722 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD47Q08722 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD47Q08722 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD47Q08722 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD47Q08722 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD47Q08722 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD47Q08722 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD47Q08722 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD47Q08722 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD47Q08722 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD47Q08722 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD47Q08722 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD47Q08722 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD47Q08722 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD47Q08722 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD47Q08722 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD47Q08722 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD47Q08722 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD47Q08722 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD47Q08722 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD47Q08722 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD47Q08722 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD47Q08722 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD47Q08722 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD47Q08722 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD47Q08722 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD47Q08722 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD47Q08722 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD47Q08722 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD47Q08722 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD47Q08722 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD47Q08722 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CD47Q08722 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD47Q08722 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD47Q08722 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD47Q08722 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD47Q08722 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD47Q08722 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD47Q08722 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD47Q08722 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD47Q08722 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD47Q08722 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD47Q08722 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD47Q08722 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD47Q08722 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD47Q08722 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD47Q08722 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD47Q08722 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD47Q08722 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD47Q08722 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD47Q08722 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD47Q08722 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD47Q08722 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD47Q08722 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD47Q08722 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD47Q08722 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD47Q08722 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms