Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL1Q08397 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXL1Q08397 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms