Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GABPB1Q06547 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPB1Q06547 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms