Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSME1Q06323 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms