Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
EXOSC9Q06265 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms