Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	RPO21	YDL140C	5202 nt		4.51	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	YPK9	YOR291W	4419 nt		4.51	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	SMF1	YOL122C	1728 nt		4.51	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	EXO70	YJL085W	1872 nt		4.51	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	SNF2	YOR290C	5112 nt		4.51	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	TYR1	YBR166C	1359 nt		4.51	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	GLN4	YOR168W	2430 nt		4.51	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	CHL1	YPL008W	2586 nt		4.51	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	USA1	YML029W	2517 nt		4.5	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	SSH1	YBR283C	1473 nt		4.5	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	VMA22	YHR060W	546 nt		4.5	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	TTI2	YJR136C	1266 nt		4.5	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	SHE1	YBL031W	1017 nt		4.5	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	POP3	YNL282W	588 nt		4.5	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	RPL18B	YNL301C	561 nt		4.5	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	YBR056W-A	YBR056W-A	201 nt		4.5	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	RCR2	YDR003W	633 nt		4.49	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	LPP1	YDR503C	825 nt		4.49	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	ASC1	YMR116C	960 nt		4.49	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	ASI2	YNL159C	870 nt		4.49	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	ALG11	YNL048W	1647 nt		4.49	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	TCB3	YML072C	4638 nt		4.49	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	BIK1	YCL029C	1323 nt		4.48	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	NHX1	YDR456W	1902 nt		4.48	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	HCM1	YCR065W	1695 nt		4.48	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	MIS1	YBR084W	2928 nt		4.48	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	RPS11A	YDR025W	471 nt		4.48	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	IES6	YEL044W	501 nt		4.48	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	AAD10	YJR155W	867 nt		4.48	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	SIW14	YNL032W	846 nt		4.48	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	YSA1	YBR111C	696 nt		4.48	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	MDM38	YOL027C	1722 nt		4.48	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	MIH1	YMR036C	1665 nt		4.48	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	TAF7	YMR227C	1773 nt		4.48	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	TAF12	YDR145W	1620 nt		4.47	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	PRE9	YGR135W	777 nt		4.47	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	RPS0A	YGR214W	759 nt		4.47	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	JLP1	YLL057C	1239 nt		4.47	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	HRT3	YLR097C	1035 nt		4.47	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	CPR3	YML078W	549 nt		4.47	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	YMR075C-A	YMR075C-A	366 nt		4.47	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	FAA1	YOR317W	2103 nt		4.47	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	CDC6	YJL194W	1542 nt		4.46	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	RKM3	YBR030W	1659 nt		4.46	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	MAG1	YER142C	891 nt		4.46	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	YGR219W	YGR219W	342 nt		4.46	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	YMR306C-A	YMR306C-A	390 nt		4.46	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	CNS1	YBR155W	1158 nt		4.46	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	TPA1	YER049W	1935 nt		4.46	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	ROD1	YOR018W	2514 nt		4.45	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	PPQ1	YPL179W	1650 nt		4.45	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	snR63	snR63	255 nt		4.45	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	BIO2	YGR286C	1128 nt		4.45	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	ERD2	YBL040C	660 nt		4.45	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	HMS1	YOR032C	1305 nt		4.45	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	OPT2	YPR194C	2634 nt		4.44	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	SAT4	YCR008W	1812 nt		4.44	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	VID28	YIL017C	2766 nt		4.44	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	YDR222W	YDR222W	1248 nt		4.44	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	MPC1	YGL080W	393 nt		4.44	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	YLR412C-A	YLR412C-A	207 nt		4.44	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	YBL036C	YBL036C	774 nt		4.44	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	AIM39	YOL053W	1188 nt		4.44	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	YBR141W-A	YBR141W-A	96 nt		4.44	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	PUF2	YPR042C	3228 nt		4.44	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	IOC4	YMR044W	1428 nt		4.44	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	BCK2	YER167W	2556 nt		4.44	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	SRO9	YCL037C	1305 nt		4.44	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	COP1	YDL145C	3606 nt		4.44	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	BOI2	YER114C	3123 nt		4.43	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	ARX1	YDR101C	1782 nt		4.43	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	SPT23	YKL020C	3249 nt		4.43	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	YDL026W	YDL026W	312 nt		4.43	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	CIR1	YGR207C	786 nt		4.43	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	MRPL6	YHR147C	645 nt		4.43	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	DPH1	YIL103W	1278 nt		4.43	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	ATG8	YBL078C	354 nt		4.43	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	SPS4	YOR313C	1017 nt		4.43	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	PWR1	PWR1	941 nt		4.43	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	SHE3	YBR130C	1278 nt		4.43	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	RSC3	YDR303C	2658 nt		4.42	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	YKL177W	YKL177W	339 nt		4.42	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	NSE1	YLR007W	1011 nt		4.42	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	ACE2	YLR131C	2313 nt		4.42	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	RPS1B	YML063W	768 nt		4.42	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	SPO20	YMR017W	1194 nt		4.42	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	YMR084W	YMR084W	789 nt		4.42	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	RNA1	YMR235C	1224 nt		4.42	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	CLB5	YPR120C	1308 nt		4.42	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	ULS1	YOR191W	4860 nt		4.41	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	NAM2	YLR382C	2685 nt		4.41	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	RTK1	YDL025C	1863 nt		4.41	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	OTU1	YFL044C	906 nt		4.41	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	SDT1	YGL224C	843 nt		4.41	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	GVP36	YIL041W	981 nt		4.41	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	SGN1	YIR001C	753 nt		4.41	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	RAD10	YML095C	633 nt		4.41	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	MED7	YOL135C	669 nt		4.41	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	LOS1	YKL205W	3303 nt		4.41	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	SPO1	YNL012W	1896 nt		4.41	□□□□□ -1.7

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17 ms