Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3AQ05086 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3AQ05086 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms