Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAP1Q03518 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms