Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP2Q03169 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP2Q03169 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms