Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREMQ03060 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREMQ03060 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREMQ03060 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREMQ03060 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREMQ03060 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREMQ03060 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREMQ03060 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREMQ03060 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CREMQ03060 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CREMQ03060 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREMQ03060 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREMQ03060 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREMQ03060 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREMQ03060 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREMQ03060 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREMQ03060 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREMQ03060 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREMQ03060 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREMQ03060 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREMQ03060 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREMQ03060 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREMQ03060 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREMQ03060 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREMQ03060 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREMQ03060 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREMQ03060 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREMQ03060 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CREMQ03060 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREMQ03060 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREMQ03060 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREMQ03060 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREMQ03060 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREMQ03060 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREMQ03060 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREMQ03060 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREMQ03060 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREMQ03060 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREMQ03060 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREMQ03060 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREMQ03060 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREMQ03060 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREMQ03060 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREMQ03060 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CREMQ03060 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREMQ03060 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREMQ03060 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREMQ03060 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREMQ03060 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CREMQ03060 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREMQ03060 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREMQ03060 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREMQ03060 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREMQ03060 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREMQ03060 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREMQ03060 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CREMQ03060 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREMQ03060 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREMQ03060 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREMQ03060 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREMQ03060 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREMQ03060 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREMQ03060 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREMQ03060 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREMQ03060 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREMQ03060 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREMQ03060 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREMQ03060 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREMQ03060 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREMQ03060 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREMQ03060 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREMQ03060 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREMQ03060 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREMQ03060 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CREMQ03060 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREMQ03060 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREMQ03060 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREMQ03060 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREMQ03060 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREMQ03060 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREMQ03060 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREMQ03060 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREMQ03060 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREMQ03060 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREMQ03060 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREMQ03060 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREMQ03060 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREMQ03060 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREMQ03060 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREMQ03060 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CREMQ03060 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CREMQ03060 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CREMQ03060 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREMQ03060 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREMQ03060 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREMQ03060 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CREMQ03060 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREMQ03060 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREMQ03060 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREMQ03060 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms