Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB1Q02641 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNB1Q02641 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB1Q02641 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.4 ms