Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms