Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms