Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms