Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms