Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms