Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms