Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F1Q01094 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F1Q01094 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F1Q01094 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F1Q01094 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F1Q01094 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F1Q01094 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F1Q01094 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F1Q01094 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F1Q01094 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F1Q01094 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F1Q01094 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.27■■□□□ 1
E2F1Q01094 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F1Q01094 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F1Q01094 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F1Q01094 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.27■■□□□ 1
E2F1Q01094 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.27■■□□□ 1
E2F1Q01094 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F1Q01094 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F1Q01094 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F1Q01094 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F1Q01094 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms