Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MDM2Q00987 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms