Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDPQ00604 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDPQ00604 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDPQ00604 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDPQ00604 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDPQ00604 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDPQ00604 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDPQ00604 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDPQ00604 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDPQ00604 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NDPQ00604 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDPQ00604 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDPQ00604 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDPQ00604 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDPQ00604 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDPQ00604 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDPQ00604 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDPQ00604 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDPQ00604 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDPQ00604 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDPQ00604 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDPQ00604 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDPQ00604 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDPQ00604 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDPQ00604 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDPQ00604 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDPQ00604 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDPQ00604 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDPQ00604 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NDPQ00604 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDPQ00604 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDPQ00604 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDPQ00604 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDPQ00604 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDPQ00604 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDPQ00604 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDPQ00604 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDPQ00604 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDPQ00604 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDPQ00604 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDPQ00604 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDPQ00604 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDPQ00604 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NDPQ00604 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDPQ00604 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDPQ00604 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDPQ00604 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDPQ00604 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDPQ00604 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDPQ00604 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDPQ00604 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDPQ00604 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NDPQ00604 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDPQ00604 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDPQ00604 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDPQ00604 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDPQ00604 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDPQ00604 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDPQ00604 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDPQ00604 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms