Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SIM1P81133 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIM1P81133 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIM1P81133 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIM1P81133 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIM1P81133 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIM1P81133 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIM1P81133 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIM1P81133 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIM1P81133 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIM1P81133 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIM1P81133 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIM1P81133 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIM1P81133 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SIM1P81133 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIM1P81133 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIM1P81133 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIM1P81133 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIM1P81133 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIM1P81133 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIM1P81133 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIM1P81133 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIM1P81133 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIM1P81133 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIM1P81133 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIM1P81133 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIM1P81133 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIM1P81133 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIM1P81133 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIM1P81133 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIM1P81133 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIM1P81133 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIM1P81133 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIM1P81133 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIM1P81133 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIM1P81133 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIM1P81133 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIM1P81133 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIM1P81133 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIM1P81133 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIM1P81133 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIM1P81133 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIM1P81133 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIM1P81133 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIM1P81133 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIM1P81133 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIM1P81133 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SIM1P81133 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIM1P81133 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SIM1P81133 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIM1P81133 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIM1P81133 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SIM1P81133 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIM1P81133 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIM1P81133 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIM1P81133 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIM1P81133 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIM1P81133 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIM1P81133 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIM1P81133 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SIM1P81133 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SIM1P81133 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIM1P81133 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIM1P81133 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIM1P81133 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIM1P81133 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIM1P81133 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIM1P81133 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIM1P81133 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIM1P81133 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIM1P81133 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIM1P81133 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIM1P81133 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIM1P81133 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIM1P81133 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIM1P81133 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIM1P81133 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIM1P81133 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms