Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFI35P80217 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFI35P80217 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFI35P80217 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFI35P80217 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFI35P80217 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFI35P80217 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFI35P80217 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFI35P80217 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFI35P80217 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFI35P80217 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFI35P80217 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFI35P80217 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFI35P80217 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFI35P80217 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFI35P80217 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFI35P80217 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFI35P80217 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFI35P80217 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFI35P80217 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFI35P80217 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFI35P80217 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFI35P80217 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFI35P80217 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFI35P80217 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFI35P80217 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFI35P80217 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFI35P80217 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFI35P80217 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFI35P80217 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFI35P80217 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFI35P80217 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFI35P80217 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFI35P80217 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFI35P80217 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFI35P80217 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFI35P80217 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFI35P80217 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFI35P80217 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFI35P80217 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFI35P80217 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFI35P80217 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFI35P80217 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFI35P80217 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFI35P80217 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFI35P80217 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFI35P80217 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFI35P80217 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFI35P80217 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFI35P80217 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFI35P80217 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFI35P80217 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFI35P80217 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFI35P80217 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFI35P80217 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFI35P80217 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFI35P80217 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFI35P80217 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFI35P80217 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFI35P80217 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFI35P80217 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFI35P80217 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFI35P80217 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFI35P80217 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFI35P80217 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFI35P80217 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFI35P80217 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFI35P80217 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFI35P80217 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFI35P80217 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFI35P80217 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFI35P80217 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFI35P80217 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFI35P80217 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFI35P80217 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFI35P80217 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFI35P80217 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFI35P80217 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFI35P80217 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFI35P80217 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFI35P80217 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFI35P80217 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFI35P80217 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFI35P80217 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFI35P80217 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFI35P80217 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFI35P80217 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFI35P80217 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFI35P80217 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFI35P80217 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFI35P80217 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFI35P80217 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IFI35P80217 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFI35P80217 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFI35P80217 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFI35P80217 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFI35P80217 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFI35P80217 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFI35P80217 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFI35P80217 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms