Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms