Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC5P78333 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC5P78333 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC5P78333 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC5P78333 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC5P78333 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC5P78333 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC5P78333 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC5P78333 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC5P78333 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC5P78333 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC5P78333 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC5P78333 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC5P78333 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC5P78333 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC5P78333 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC5P78333 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC5P78333 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC5P78333 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC5P78333 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC5P78333 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC5P78333 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC5P78333 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC5P78333 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC5P78333 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC5P78333 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC5P78333 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC5P78333 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC5P78333 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC5P78333 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC5P78333 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC5P78333 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC5P78333 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC5P78333 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC5P78333 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC5P78333 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC5P78333 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC5P78333 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC5P78333 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC5P78333 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC5P78333 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC5P78333 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC5P78333 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC5P78333 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC5P78333 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC5P78333 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC5P78333 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC5P78333 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC5P78333 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC5P78333 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC5P78333 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC5P78333 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC5P78333 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC5P78333 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC5P78333 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC5P78333 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC5P78333 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC5P78333 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC5P78333 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC5P78333 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC5P78333 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC5P78333 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC5P78333 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC5P78333 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC5P78333 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC5P78333 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC5P78333 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC5P78333 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC5P78333 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC5P78333 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC5P78333 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC5P78333 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC5P78333 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC5P78333 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC5P78333 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC5P78333 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC5P78333 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC5P78333 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC5P78333 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC5P78333 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
GPC5P78333 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPC5P78333 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC5P78333 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC5P78333 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC5P78333 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC5P78333 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC5P78333 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC5P78333 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC5P78333 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC5P78333 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC5P78333 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC5P78333 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC5P78333 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC5P78333 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC5P78333 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC5P78333 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC5P78333 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC5P78333 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC5P78333 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC5P78333 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms