Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms