Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ERVK-24P63145 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERVK-24P63145 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVK-24P63145 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVK-24P63145 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVK-24P63145 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVK-24P63145 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVK-24P63145 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVK-24P63145 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVK-24P63145 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK-24P63145 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK-24P63145 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK-24P63145 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK-24P63145 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK-24P63145 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK-24P63145 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK-24P63145 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK-24P63145 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK-24P63145 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-24P63145 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-24P63145 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVK-24P63145 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms