Protein–RNA interactions for Protein: P62899

RPL31, 60S ribosomal protein L31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL31P62899 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL31P62899 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL31P62899 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL31P62899 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL31P62899 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL31P62899 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL31P62899 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL31P62899 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL31P62899 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL31P62899 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL31P62899 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL31P62899 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL31P62899 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL31P62899 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL31P62899 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL31P62899 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL31P62899 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL31P62899 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL31P62899 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL31P62899 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL31P62899 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL31P62899 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL31P62899 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL31P62899 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPL31P62899 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL31P62899 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL31P62899 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL31P62899 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL31P62899 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL31P62899 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL31P62899 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL31P62899 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL31P62899 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL31P62899 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL31P62899 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL31P62899 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL31P62899 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL31P62899 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL31P62899 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL31P62899 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL31P62899 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL31P62899 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL31P62899 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL31P62899 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL31P62899 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL31P62899 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL31P62899 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL31P62899 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL31P62899 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL31P62899 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL31P62899 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL31P62899 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL31P62899 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL31P62899 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL31P62899 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL31P62899 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL31P62899 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL31P62899 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL31P62899 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL31P62899 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL31P62899 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL31P62899 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL31P62899 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL31P62899 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL31P62899 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL31P62899 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL31P62899 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL31P62899 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL31P62899 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL31P62899 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL31P62899 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL31P62899 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL31P62899 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL31P62899 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL31P62899 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL31P62899 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms