Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLR2LP62875 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms