Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS28P62857 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS28P62857 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS28P62857 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS28P62857 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS28P62857 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS28P62857 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS28P62857 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS28P62857 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS28P62857 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS28P62857 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS28P62857 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS28P62857 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS28P62857 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS28P62857 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS28P62857 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS28P62857 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS28P62857 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS28P62857 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS28P62857 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS28P62857 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS28P62857 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS28P62857 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS28P62857 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS28P62857 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS28P62857 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS28P62857 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS28P62857 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS28P62857 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS28P62857 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS28P62857 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS28P62857 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS28P62857 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS28P62857 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS28P62857 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS28P62857 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS28P62857 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS28P62857 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS28P62857 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS28P62857 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS28P62857 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS28P62857 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS28P62857 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS28P62857 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS28P62857 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS28P62857 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS28P62857 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS28P62857 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS28P62857 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS28P62857 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS28P62857 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS28P62857 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS28P62857 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS28P62857 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS28P62857 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS28P62857 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RPS28P62857 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RPS28P62857 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RPS28P62857 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
RPS28P62857 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS28P62857 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS28P62857 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS28P62857 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS28P62857 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS28P62857 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS28P62857 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS28P62857 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS28P62857 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS28P62857 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS28P62857 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS28P62857 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS28P62857 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS28P62857 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS28P62857 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS28P62857 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS28P62857 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS28P62857 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS28P62857 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS28P62857 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms