Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SNRPEP62304 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNRPEP62304 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms