Protein–RNA interactions for Protein: P62079

TSPAN5, Tetraspanin-5, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN5P62079 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN5P62079 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN5P62079 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN5P62079 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN5P62079 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN5P62079 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN5P62079 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN5P62079 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN5P62079 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN5P62079 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN5P62079 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN5P62079 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN5P62079 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN5P62079 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN5P62079 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN5P62079 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN5P62079 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPAN5P62079 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms