Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UFM1P61960 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UFM1P61960 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
UFM1P61960 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UFM1P61960 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UFM1P61960 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UFM1P61960 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UFM1P61960 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UFM1P61960 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
UFM1P61960 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UFM1P61960 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
UFM1P61960 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
UFM1P61960 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UFM1P61960 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UFM1P61960 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
UFM1P61960 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UFM1P61960 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UFM1P61960 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UFM1P61960 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UFM1P61960 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UFM1P61960 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UFM1P61960 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UFM1P61960 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UFM1P61960 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UFM1P61960 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
UFM1P61960 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UFM1P61960 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UFM1P61960 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UFM1P61960 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UFM1P61960 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UFM1P61960 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UFM1P61960 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UFM1P61960 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UFM1P61960 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UFM1P61960 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UFM1P61960 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UFM1P61960 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UFM1P61960 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UFM1P61960 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UFM1P61960 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UFM1P61960 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UFM1P61960 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UFM1P61960 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UFM1P61960 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UFM1P61960 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UFM1P61960 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UFM1P61960 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UFM1P61960 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UFM1P61960 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UFM1P61960 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UFM1P61960 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UFM1P61960 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UFM1P61960 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UFM1P61960 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UFM1P61960 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UFM1P61960 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UFM1P61960 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UFM1P61960 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UFM1P61960 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UFM1P61960 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UFM1P61960 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UFM1P61960 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UFM1P61960 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UFM1P61960 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UFM1P61960 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UFM1P61960 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UFM1P61960 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UFM1P61960 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UFM1P61960 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UFM1P61960 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UFM1P61960 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UFM1P61960 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UFM1P61960 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UFM1P61960 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UFM1P61960 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UFM1P61960 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UFM1P61960 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UFM1P61960 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UFM1P61960 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UFM1P61960 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UFM1P61960 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UFM1P61960 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UFM1P61960 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UFM1P61960 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UFM1P61960 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UFM1P61960 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UFM1P61960 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UFM1P61960 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UFM1P61960 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UFM1P61960 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UFM1P61960 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UFM1P61960 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UFM1P61960 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UFM1P61960 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UFM1P61960 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UFM1P61960 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UFM1P61960 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UFM1P61960 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UFM1P61960 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UFM1P61960 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms