Protein–RNA interactions for Protein: P61163

ACTR1A, Alpha-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1AP61163 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTR1AP61163 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR1AP61163 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms