Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms