Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms