Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00315P59091 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms