Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms