Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA9P57773 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA9P57773 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA9P57773 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GJA9P57773 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA9P57773 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA9P57773 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA9P57773 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA9P57773 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA9P57773 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA9P57773 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA9P57773 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA9P57773 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA9P57773 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA9P57773 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA9P57773 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA9P57773 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA9P57773 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA9P57773 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA9P57773 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA9P57773 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA9P57773 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA9P57773 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA9P57773 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA9P57773 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA9P57773 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA9P57773 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA9P57773 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA9P57773 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA9P57773 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA9P57773 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA9P57773 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA9P57773 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA9P57773 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA9P57773 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA9P57773 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA9P57773 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA9P57773 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA9P57773 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA9P57773 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA9P57773 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA9P57773 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA9P57773 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA9P57773 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA9P57773 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA9P57773 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA9P57773 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA9P57773 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA9P57773 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA9P57773 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA9P57773 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA9P57773 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA9P57773 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA9P57773 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA9P57773 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA9P57773 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA9P57773 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA9P57773 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA9P57773 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA9P57773 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA9P57773 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA9P57773 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA9P57773 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA9P57773 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA9P57773 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA9P57773 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA9P57773 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA9P57773 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA9P57773 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA9P57773 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA9P57773 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA9P57773 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA9P57773 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA9P57773 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA9P57773 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA9P57773 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA9P57773 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA9P57773 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA9P57773 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA9P57773 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA9P57773 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA9P57773 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA9P57773 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA9P57773 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA9P57773 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA9P57773 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA9P57773 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA9P57773 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA9P57773 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA9P57773 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA9P57773 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA9P57773 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA9P57773 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA9P57773 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA9P57773 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA9P57773 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA9P57773 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA9P57773 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA9P57773 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA9P57773 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms