Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WNT3AP56704 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WNT3AP56704 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms