Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OXCT1P55809 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
OXCT1P55809 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms