Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMP1P54849 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMP1P54849 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMP1P54849 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMP1P54849 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMP1P54849 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMP1P54849 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMP1P54849 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMP1P54849 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMP1P54849 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMP1P54849 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMP1P54849 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMP1P54849 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMP1P54849 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMP1P54849 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EMP1P54849 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMP1P54849 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMP1P54849 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMP1P54849 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMP1P54849 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMP1P54849 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMP1P54849 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMP1P54849 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMP1P54849 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMP1P54849 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMP1P54849 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMP1P54849 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMP1P54849 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMP1P54849 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMP1P54849 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMP1P54849 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMP1P54849 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMP1P54849 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMP1P54849 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMP1P54849 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMP1P54849 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMP1P54849 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMP1P54849 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMP1P54849 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMP1P54849 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMP1P54849 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMP1P54849 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMP1P54849 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMP1P54849 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMP1P54849 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMP1P54849 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMP1P54849 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMP1P54849 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMP1P54849 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMP1P54849 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms