Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD23AP54725 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD23AP54725 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms